Les terres de Fontcoberta per la seva ubicació, properes al Mediterrani, formen part d'un tipus de clima temperat anomenat mediterrani. A Fontcoberta es dóna el clima mediterrani humit, de transició entre el clima mediterrani de la plana -com el de Figueres- i el submediterrani -com el d'Olot- i que es localitza a les proximitats de les muntanyes de l'interior: Serralada transversal, Prelitoral, etc. Els observatoris d'Anglès, Breda, Castanyet i Girona presenten característiques semblants al de Fontcoberta.

Sempre hi ha però, microclimes al municipi amb lleugeres variacions. El pla de Melianta, per exemple, és una zona ben airejada sobretot pels vents atramuntanats i pels migjorns, donat que es divisori de les conques del Ter i el Fluvià. Les gelades o gebrades d'hivern sempre són més intenses a les fondalades de les nostres rieres. L'estany d'Espolla tempera, a l'hivern, les temperatures dels entorns propers puix és una massa d'aigua prou calenta en comparança amb la de l'aire - entre els 15 i 20 graus més elevada en períodes d'onada de fred- i, això, es veu en les gropades de boirina de no més de dos metres d'alçada que s'hi formen i que llisquen suaument per la superfície de l'aigua per morir a la seva riba. Sempre hi ha aquell racó ombrívol i humit a les nostres fonts, de vegetació esponerosa, on notem una sensació d'agradable bonança que ens ajuda a retrobar la serenor. I els boscos, tan freqüents, aminoren i suavitzen les temperatures tant a l'hivern com a l'estiu. Les obagues més humides i força selvàtiques dels nostres turons a diferència dels solells més exerreïts i amb vegetació adaptada a l'eixutesa. Són algunes de les variacions del clima de casa nostra, certament gens avorrit i variat, molt ric per als observadors sensibilitzats.